Каким образом лучше отправлять вовне сообщение об ошибке, возникшей в процессе работы фм веб-сервиса?

Во первых вам лучше в форум PI это спросить. Во вторых есть в soap fault для этого, если интерфейс синхронный.

С помощью выходного параметра, например EV_SUBRC.
Обработку внутри ФМ оборачивайте в try ..catch, в catch-секции устанавливаете код возврата (либо текст ошибки).

Спасибо!