Нужно сделать счет-фактуру с 100% скидкой. Речь не о рабате.
То есть скидка обычно выглядит так:
дебитор - 70р
доход - 100р
скидка - 30р

Но при 100% скидке, счет дебитора вовсе выпадает, т.к. туда кидается разность:
доход - 100р
скидка - 100р

Но эта проводка необходима финансистам, чтобы она отражалась в актах-сверки и др. отчетах, как
Дебитор - 100,
Дебитор(скидка) -100

доход - 100р
скидка - 100р

Это обычно делалось корректировочной счет-фактурой, либо через FI, но ввиду увеличения количества таких акций нужно как-то автоматизировать.

Можно ли это реализовать технически одной сч-фактурой?

Технически, думаю, можно.
Т.к. к одной фактуре разрешено проводить отдельные позиции дебитора по каждой позиции.