Добрый день.
Подскажите, пожалуйста, можно ли настройками сделать активным поле "Ссылка" в деблокированной фактуре?

Заходи в транзакцию FB02 - Заголовок.

Настройками - нет. Через ABAP можно. Но я бы не рекомендовал, т.к. если она деблокирована, то значение поля уже "ушло" в проводки по разным модулям, в т.ч. FI.