Можно ли как-то определить, какая версия (3.5 или 7.0), например, у куба, в Бизнесс Контенте?

А то, получается, приходится сначала делать объекту инсталл, и уже потом вычислять это по "датафлоу-корню".

Репозиторий метаданных?

Ну да, отчасти вариант.
Там правда версии нет, но по времени можно ориентироваться по крайней мере.