После переноса новой книги, а так же соответствующих ролей получил парадоксальную ситуацию. В продуктивной системе, смотрю транзакцией pfcg, вижу что отчет присутствует в меню пользователя, но в Analyser'е при открытии не виден, так же не ищется поиском. В каком направлении еще поработать?

Попробуйте присвоить рабочую книгу в эту роль.

А выравнивание пользователей после переноса роли делали?