При запуске цикла косвенного перерасчета работ (ksc5: отправитель – МВЗ, получатель - ТОРО-заказы) в отдельных позициях (МВЗ-отправителя и заказа-получателя) по данной операции отображаются и сформировавшееся количество работ, и тариф по этим работам (при этом сумма затрат распределяется на ТОРО-заказы). Дальнейший расчет фактического тарифа и повторная оценка ТОРО-заказов в отдельных позициях не отображаются.
Почему при запуске цикла косвенного перерасчета формируется тариф, а в отдельных позициях операция «повторная оценка» не отражается?

А как вы определили, что не отображается? если по фильтру на операцию, то возможно, что у вас в настройках версии (okeqn) не настроена отдельная операция для дооценки...

У нас в настройке версии указанно для Повторной Оценки - Собственная операция. В этом причина?

ну если "Собственная операция", то проблема не в этом...