Plank написал:
1. "банк в этот день файл не принял". Почему не принял? Должно быть объяснение со стороны банка. Возможно, сбой все цепочки именно из-за ошибки в SAP-системе, повлекшей непринятие файла.
2. "Разнес ее". Что под этим подразумевается? Статус позиций выписки в тр. FEBAN зеленый, а позиции не выравнены?
Или красный, тогда можно включить проводку в видимом режиме и журнал проводок, и посмотреть что происходит при проводке.

Наверное, вы вбивали п/п в клиент-банке с одними номерами, а в SAPе они с другими, вот система и не может найти позиции по номеру п/п, который пришел в выписке.
Я так понимаю, здесь есть две проблемы:
1. Банк не принял
2. не выравниваются.
Чего я здесь не увидел - вопроса. Насколько я понял, вопрос не в том, почему банк не принимает вашу выгрузку, а почему не выравниваются платежи с начислениями. Но из объяснения не понял, как именно вы выравниваете. Виды документов в данном случае - бесполезная для анализа информация. АПП работает так, что после прогона блокирует выравнивание любым способам кроме как по номеру платежки. Причем тому номеру, который сформирован самой АПП и записан в поле BSEG-PYORD. Если из банк-клиента пришли какие-то другие номера платежек, то задача выравнивания сильно усложняется.
Варианты:
1. До загрузки в тексте выписки поменять кривые номера платежек с банк-клиентских на прямые - PYORDовские. После этого грузить.
2. Быдлокодингом или каким другим хакингом (если мало позиций - можно и в отладчике) поменять неправильные значения на правильные в таблице FEBCL. Там живут внешние ключи для выравнивания. Под рукой системы нет сейчас, точно название поля назвать не могу, но если посмотрите - сами увидите где значения менять.
3. Если вы разнесли платежи на кредиторов бз выравнивания, то придется вручную запускать по каждой позиции платежа выравнивание позиции, причем выравнивать по параметру Номер ПП.
4. Если вы не разнесли выписку, то можно поступить так, как описал Plank.
Но, судя по всему, документ вида RS говорит о том, что вы разнесли без выравнивания в дебет кредитора. Посему опять возникает ветвление вариантов. У нас же есть главный расчетный счет, счет авансов, а в общем случае - и 76-й по претензиям. Итак, варианты:
1. Вы правильно разнесли конкретную позицию выписки на счет ГК. Тогда вам нужно запускать выравнивание документа, по параметру номер ПП.
2. Вы разнесли в дебет основного счета расчетов с кредитором, а нужно было кидать в авансовый. Тогда нужно делать перенос проводки с выравниванием с документа разноски выписки. Практически любым способом. Она закроет позицию на неправильном счете и откроет на правильном. После этого выровнять по номеру ПП позицию на правильном счете ГК. В этом варианте накувыркаетесь с Книгой покупок.
вот как-то так