Подскажите как правильно должно выглядеть перевыставление затрат?

Опишите хоть немного бизнес-процесс, который хотите реализовать. Тогда вам подкинут идеи.
А так ваш вопрос по сути не о чём... Не понятно чего вы хотите

Ну скажем примерно вот это в жизни, и как вы бы это реализовали:

Получаем СФ от поставщика услуг, регистрируем все как обычно (ММ-заказ, ПМ, СФ),
затем данные затраты необходимо переадресовать клиенту без наценки, а по некоторым услугам с фиксированной наценкой (абсолютной).

вот как бы вы реализовывали?

Например, как Обработку заказа на поставку третьему лицу

http://help.sap.com/saphelp_erp2005/hel ... ameset.htm

А в сбытовой семе калькуляции предусмотрел бы возможность указывать Надбавки (наценка в вашей терминологии).