Не вижу настройки, где можно было бы присвоить новый номер для диапазона номеров подтверждений к кокому-либо объекту. Это "зашито" в системе? Или выход есть?

Да, это зашито. Объект PD_SEQ_NR, диапазон 01. Поменять получится только через enhancement.