Объясните, пожалуйста, может ли повлиять галка (Для движения денежных средств) в основных данных основного счета на закладке
(Ввод банковских процентов - Банковские/финансовые данные в БЕ), транзакция - fss0 на формирование отчета (4 Форма - ОДДС ).

Насколько я понимаю, нет. Да и при беглом анализе программы J_3RFFORM4 я не увидел использования поля XGKON.

Судя по help.sap.com, это поле нужно для других вещей. Эта галка используется кстати при формировании актов сверки для дебиторов и кредиторов (J3RFASK , J3RFASD). В частности, если прошел платеж по счету где не стоит галка "Для движения денжных средств", этот платеж не отобразится в списке отдельных позиций платежей в актах сверки (именно в формуляре, печатной форме - при печати формуляра). Хотя общая сумма платежей будет верна.

Может коллеги подскажут, где она используется еще...

А в чем у вас проблема?

Управление наличностью.