Добрый день!
Поиск по форуму ни к чему не привел, а может плохо искал.
Можно ли стандартно, сделать так, чтобы система не разрешала создавать Входящую поставку, если к заказу, к которому она создается отсутствует счет фактура?

Настройками - нет.