AS02, закладка "данные, зависимые от времени". Захожу в другие интервалы, добавляю новый интервал, в нём ставлю новое мвз. Получается:

с 1.11.2008 МВЗ-2
с 1.01.1900 МВЗ-1

Радуюсь жизни, сохраняю. Захожу в просмотр - картина совсем другая:

с 1.01.1900 МВЗ-2

С другими контировками всё благополучно.

Более того, в настроечной системе интервалы сохраняются правильно. Для проверки переношу заново все свои запросы, сравниваю настройки. Всё одинаково! МВЗ продолжает исчезать.

Что это может быть?

Разобрались.
Это была лишняя галочка в спецификации ведения организационных единиц вне зависимости от времени.