В системе есть дебиторы с одинаковыми банковскими реквизитами, напрмер, плательщик и грузополучатель. При загрузке выписки (ff.5, формат мультикэш) дебитор ищется в таблице банковских данных KNBK по БИК и номеру счета. Какой дебитор в итоге подцепится? Первый найденный?
Другой пример. Созданы контрагенты для платежей в бюджет - ГИБДД, транспортный налог, ФФОМС и т.д. и т.п. У этих кредиторов один расчетный счет. В платежках аналитика по каждому перечислению ведется с помощью КБК. Есть ли возможность при загрузке выписки вешать платеж на нужного контрагента?

По номеру платежки.

Это возможно в том случае, если в SAP и Клиент Банке синхронизированы номера платежек, т.е. платежки первоначально создаются в r/3 и загружаются в Клиент Банк. А если настроена только загрузка выписки, то никак?

создавайте платежки в r\3

видимо придется первоначально бухи решили загружать только выписку

Она никакого не подцепит, если нету каких-либо других данных (номер платежки)