Необходимо выполнить поступление ОС с начсленной амортизацией от филиала (подразделения нашей организации), т.е. следующие проводки:
1. Д01 - К79
2. Д79 - К02
транзакцией ab01 удалось получить проводку 1. Каким образом можно создать проводку 2.?

Обе строки в одном документе можно получить использовав вид движения 148

Спасибо за ответ, но было бы интересней получить отдельно операцию
2. Д79 - К02
даже если отдельным документом. Возможно ли это?

А зачем?

Потому что в этом случае возникает FI документ с движением:
01 +100
02 -2
79 -98

что можно интерпретировать как:
Д01 - К02 2
Д01 - К79 98

а оборот 01-02 - не нужен

Много чего можно по разному интерпретировать, что ж теперь, все разными документами проводить?
Такая интепретация этого документа тоже возможна и она и является правильной:
Д01 К79 100
Д79 К02 2

это не правильная интерпретация, (хоть и дает правильный результат), потому что в движении
01 +100
02 -2
79 -98
нет суммы 100 по счету 79, а только по 01
но не в этом дело, я просто хотел узнать как можно сделать проводку
Д79 - К02 отдельно, и можно ли это вообще.

Если стандарт не подходит, можно попробовать изобразить схему проводок. Этот инструмент тут регулярно обсуждается.