hyperion/cognos etc.
и можно ли использовать для этих целей R/3

Точно знаю, что пользуют BW-SEM...
В R/3 есть только инструменты для ввода и контроля бюджета, но не для его составления

Если имеется ввиду весь цикл бюджетирования - от операционных бюджетов до прогнозного баланса - то думаю нормально это нигде не реализовано В SAP есть (PS) бюджет затрат и бюджет платежей и управление фондами.

Еще есть специальное решение - Industry Solution for Public Sector (ну или было во всяком случае)

PS, а точнее IS-PS (Public Services) и есть решение которое пришло в 4.7 на замену FM 4.6 и его я имел ввиду

Из отечественных - Контур www.iso.ru
Из импортных - Оракл EBP
Наше дешевле, Оракловое типа мощнее, но для контор среднего размера (не глобальных) ИМХО это не актуально.