Доброго дня, подскажите коллеге из FI плиз.
Как поставить блок при проведении реализации на отсторнированные сч-ф?

А что вы понимаете под процессом "проведении реализации на отсторнированные сч-ф"?

я не сбытовик прошу не судить строго,

бухи выставили счет, затем его отсторнировали, а потом запустил прогу по deferred revenue в который попал этот отсторнированный счет.

И что это за прога, какой код транзакции?

код транзакции Z*

1) проводит на ОГК T
2)отводит ОГК T по периодам
3) выравнивает позиции по ОГК T

знаю в сбыте есть настройки по стандартному Deferred revenue, но мы пока сидим на Z.

Ну, если z-разработка не учитывает ситуацию сторнированных фактур, выход только один - обратиться к абап-разработчикам, для ее доработки.
Форум тут вряд ли поможет.

в стандарте нет настроек?

Никто же не знает какой алгоритм выборки данных реализован в вашей Z программе.
КАк уже советовали - для фильтрации данных(чтобы не учитывались сторнированные фактуры), обратитесь к консультанту/разработчику.