Хотелось бы узнать рекомендации с точки зрения интеграции ТОРО и Основных средств.

На уровне каких объектов она осуществляется и в чем преимущества различных вариантов если таковые существуют.

Если в кратце, то стоит классический вопрос детализации основных данных. Очевидно что детализация со стороны объектов ТОРО намного больше, в то время как со стороны Основных Средств нет желания опускаться до такой детализации. Собственно вопрос стоит ради чего это можно или нужно/не нужно делать.

Если у меня одно ОС состоит из нескольких объектов оборудования, то могу ли я заменить один отдельный агрегат? При этом срок службы ОС изменится синхронно для всех агрегатов или только для замененной компоненты?

Заранее всем спасибо (кроме RTFM)!

Что касается настройки, тут классический RTFM
Настройки по интеграции ЕО <==> ОС расположены в ветке SPRO -> Финансы -> Учет основных средств -> Основные данные -> Автоматическое создание основных записей оборудования.

Особенности методологии надо узнавать у бухов по учету ОС.
Замена отдельных компонент или агрегатов в составе ОС (капитальный ремонт) не приводит к изменению балансовой стоимости, на изменение технических характеристик, да и на срок службы (вроде бы) не должно влиять. На производстве срок службы оборудования как правило определяется экспертизой промышленной безопасности (ЭПБ).