Если вы решили использовать не sap-кие средства для копирования, почему не использовать RMAN? Очень удобный инструмен.
Мне не понятно причем тут shutdown.

Решал не я
Исторически сложилось, так сказать. Конечно же я уже в поисках. Тока проблема в том , что я "зелен" еще, ведущий уехал и я остался один - не успеваю все.
Про shutdown: в саповской ноте вычитал, что это баг Oracle 9(после попытки остановить базу более часа сессия прерывается), а вот почему уже целый час - мне непонятно(как правило 15 секунд уходило). Ну а фактически то бэкапится с помощью BRBACKUP(в логе вызывается команда с ключами) - поправьте , если я неправ.

Самое интересное то, что после перезапуска прошло пару недель и все было хорошо, затем возникла еще одна такая же ситуация - опять перезапуск, но даже нескольких недель не продержалось:(