Подскажите пожалуйста можно ли настроить проводки амортизации так чтобы для каждого ОС создавался отдельный бухгалтерский документ.

нет

Ну а хотя бы отдельный БУ-документ на каждый счет/объект контировки?

Можно сделать хитрючий финт ушами, и таки добиться этого результат.
1. Строим отчет по запланированной за месяц амортизации, сохраняем его в файл.
2. Настраиваем LSMW проект, который читает этот файл, и на наждую ОСину формирует бух документ. Элементарно.
Только как при этом контролировать, все ли проведено!!! ;( Поэтому эта идея у нас умерла, не успев быть озвученной.

Посмотрите:
http://sapboard.ru/forum/viewtopic.php?t=9591
Может поможет.