В заголовке регистра есть поля:
Приложение
Субприложение
Оценка
Сылочный регистр

Можен кто знает как их можно использовать?

Первые три поля имеют сугубо информативную нагрузку - реально их значаения нигде не используются. Поле "Ссылочный регистр" используется для связи специального регистра с вспомогательной книгой GL. Посмотрите help к полю - там все расписано.