Сложилась такая ситуация:
- проект и сетевой график создаёт проектная организация (у неё одна БЕ)
- заявку на потребность формирует другая, т.к. проект для неё(у неё несколько БЕ)
- заявку на закупку, контракт и заказ на поставку третья (у неё несолько БЕ). Эта организация-закупщик.

Сейчас решение настроено таким кривым образом:
Когда создаётся Проект указывается одна из БЕ закупщика.
В сетевом графику необходимо указывать завод - указывается основной завод закупщика.
Далее создаются заявки на потребность. В позициях материалы с контировкой Q.
Далее создаются заявки на закупку. В позициях материалы с контировкой Q.
И т.д.

БЕ и Завод закупщика указывается из-за того, что его нельзя поменять ни в заявке, ни в контракте, ни заказе, т.к. он не может отличаться от БЕ и завода СПП-элемента и сетевого графика. Система этого делать не позволяет.
В итоге получается парадоксальная ситуация: проектная организация определяет за закупщика через какую структуру должны производиться закупки.
Можно ли как то отвязать друг от друга сами проекты и процесс закупок?

зачем БЕ1 планирует материалы за БЕ3? пусть это делает БЕ3.
БЕ3 в любом случае в потребности указывать придется, если не хотите иметь усложненный процесс с "продажей" между несколькими БЕ.