Мне надо распечатать всю структуру проекта (CJ20n). Пытаюсь воспользоваться транзакцией CN41, все прекрасно, но почему-то по тем СПП-элементам, где прошли заказы затраты дублируются. Не могу понять в чем проблема, почему суммы дублируются

Какие затраты - плановые или фактические?

плановые. то тем позициям, где прошел заказ, план удвоился

Т.е. вы запланировали вручную на СПП затраты + разместили заказ на СПП - и план.затраты по заказу добавились к план.затратам определенным для СПП вручную? Если да, то посмотрите тр. OPSV - если нет необходимости отражать на СПП план.затраты, размещенные на заказе - деактивируйте соответствующий индикатор.