Валюта всех БЕ и компании - RUB, валюта КЕ - RUN.
Чем это может грозить в дальнейшем?
Хотелось бы вести все в одной валюте, но так случилось, что в КЕ она другая.

Введите курс перерасчета 1 run = 1 rub и наоборот. По идее, проблем быть не должно.

Sent from my HTC Desire using Tapatalk 2

А вообще что такое RUN и зачем он введен сапом?

Согласен с DarkDuck-ом, проблем не должно быть.
просто посмотрите как у вас настройки сделаны.
у нас, например, есть USD и USN.
разница между ними - десятичные разряды и только.