Добрый день.

Кто-то сталкивался с такой проблемой, что из реестра (J_1UF_REGISTER_IN_OUT) не все накладнные выгружаются в XML?

Методом "проб и ошибок" дошёл до следующего:
Есть замечательная табличка BKORM, в которую пишутся запросы корреспонденции, как я понимаю.
Так вот выгружаются только те накладные, для которых в этой таблице есть соответствующая запись.
После установки одной из последних нот корреспонденция автоматически проводится при создании накладной (J_1UNCREATE).
По F.61 созданные накладные печатаются без проблем. Но, видимо, не все вносятся в таблицу BKORM.

Как это можно победить?