На селекционном экране Программы корреспонденции счетов J3RKKRL имеется опция "Документы с нулевыми позициями". В документации эта опция не описана. Что обозначает данная опция?

Означает, что программа определения корреспонденции так же будет обрабатывть документы с нулевыми позициями в ВТ и ВВ. Мне кажется, что эта галка интересна только если у вас реализован учет в несколькольких валютах.

"Мне кажется, что эта галка интересна только если у вас реализован учет в несколькольких валютах."
Не только, например, еще переоценка, выравнивание в валюте.

Я точно не помню, пожалуйста поправьте если не прав, но вроде галка имеет влияние только на документы у которых сумма ВВ = 0 и сумма ВТ = 0, а при переоценке сумма ВВ <> 0 следовательно галка на переоцеку не влияет, так?

Помню что когда делал для 4.7, там имело значение именно ВТ.
Сейчас посмотрел в 6, все совсем смешно, поле есть, но нигде в программе не используется, т.е. отчет всегда показывает все документы вне зависимости от значения поля - "Документы с нулевыми позициями"

На документы переоценки не влияет. Если у вас для БУ активна еще хотябы одна валюта, например, валюта концерна, то у вас будут документы с нулевой ВТ и ВВ, тогда можно использовать эту галку.