Здравствуйте!
Подскажите, пожалуйста, как нам реализовать следующую схему:
Счет нам выставляет РЖД, но деньги мы должны платить другой организации как последующую оплату. Альтернативный плательщик не подходит. Деньги должны отражаться на второй организации. Авансами отправлять тоже не можем.
Спасибо. Жду ответа.

Ну и вводите счета от одной организации, а платите другой. В чем конкретно проблема?

Проблема в том, что оплата последующая, т.е. я ее должна создать со ссылкой на СФ. Но тогда деньги отразятся на РЖД. А деньги должны отражаться на другой организации. Я могу создать оплату авансами на второй организации и выровнить СФ РЖД этими деньгами, но это будет не правильно. Нужно, чтобы была последующая оплата на второй организации, а на самой этой организации нет СФ, она на РЖД.

У вас какая-то диковинная ситуация.
У вас счет задолженности кредитуется на РЖД, а дебетуется на другого партнера.
Вы все равно должны будете выравнивать эти вещи, а "пары" к ним нет. Система так или иначе создаст проводку по дебету РЖД и по кредиту получателя средств.
А это будет равносильно переносу с РЖД на нового партнера.
Если так хочется платить именно на него, сделайте справкой проводку с выравниванием задолженности перед РЖД, откроется аналогичная перед получателем.
Данную позицию используйте для постоплаты.
Но, по-моему, это какая-то ересь.