Добрый день. Вероятно эта тема поднималась, но к сожалению не смогла найти. В книге покупок операция по 0% НДС в ALV попадает таким образом (например) БАЗА НДС 0% + 1250, НДС 0% - 1250. Почему так? Как избавиться от отрицательной суммы? Спасибо за понимание.

Насколько я понимаю, правильным будет ситуация где у вас в отчете будет:
База НДС 0% 1250
НДС 0% 0

А у вас код налога правильно настроен?

Да, именно так и нужно, код налога выдялит так:

Tax type - Input tax

Base amount 100
Input tax - VST - 0,000 110 100
...
Tax Accounts - VST - 11188301 (19.1)

OBCG
A0 - Input.. - VST 3
OBCH
A0 - Input... - VST 3

Разобрались. Это лечится обновлениями, а именно нота 1351387.