Ситуация:
Возникла потребности вести бюджетирование по неделям.
Я предложил заводить на каждую неделю один новый фонд. У фонда определены сроки действия, отчеты удобно будет смотреть и так далее.

Примеры:
"2009Март1" 01.03.2009 - 08.03.2009 "Фонды для понедельной аналитики"
"2009Март2" 09.03.2009 - 16.03.2009 "Фонды для понедельной аналитики"
Фонд присвоим к виду фондов. Вид фондов приписан к виду бюджета, для назначенного бюджета.

Вопросы:
1. Как грамотно сделать так, чтобы система на основании текущей даты брала бюджетные данные из действительного на текущий момент фонда?
2. Как эффективно решается текущий вопрос деривацией, поскольку в большинстве транзакций поле "фонд" отсутствует?
3. Как сделать так, что неизрасходованные средства недействительного фонда никуда не лезли?

Конечно, все зависит от ваших задач и целей.
Если цель просто занести бюджетные значения по неделям и получать факт по неделям и проводить сравнительный анализ всего этого, то мне кажется что вам достаточно будет использовать регистры. Сделайте, например для платежного бюджета, 52 дополнительных регистра. И при вводе бюджета по дате документа определяйте к какой неделе относится этот документ, складывайте его регистр для этой недели. А с фактом все просто: по дате проводки так же относите его в этот же регистр.
Все стандартные и свои отчеты содержат регистр на селекционном экране. Получить план-факт-отклонения проще простого.
Реализация простая.

Все таки с фондами как-то не особо на мой взгляд.

Речь идет о регистрах контроля наличия?
Где (программа/транзакция) вы назначаете дату документа к регистру АКН?
Регистр выбирается при вводе бюджета в FMBBC, так, да?

Например, в fmbbc есть поле "Дата документа" - вполне его можно задействовать для определения недели.

Регистр определяется автоматически при вооде документа по дате, например.

а где само разграничение регистрами настраивается?

BADi пишите по АКН.