Каким образом связываются элементы CO (МВЗ,СПП...) c ПФМ?

Смотря какая версия системы.
1) В версиях младше 4.7 используются тр.FRC*,где вместо * надо подставить цифру присвоения
2) Начиная с версии 4.7 применяется механизм деривации:
-- тр.FMRULES - активация деривации объектов CO
-- тр.FMDERIVE- прописываете присвоения в появившемся правиле деривации.

Не могу понять почему при присвоении КЕ-ЕФМ(ofc1) выходит сообщение
"Производительность:проверте параметры контроля наличия"

Ну это-то как раз просто объясняется: если, например, активирован контроль наличия по СПП и по ПФМ-ФП, то это может вызвать определенные тормоза. По судите сами АКН будет отрабатывать два раза и это при достаточно большом объеме данных вызовет падение производительности.
Насколько помню сообщение должно быть предупреждающим, разве нет?

СПАСИБО