Можно ли и как в отчетах использовать элементы иерархий? Приходится сейчас в наборах либо перебивать конкретные значения либо использовать с... по...

Ставишь в шедулер на каждую ночь тр. FMRP_CI_SET_HIER и тр. FMRP_FC_SET_HIER .
Автоматически создаются наборы с полной копией иерархии ПФМ и ФП, которые потом можно использовать в отчетах Report Painter \ Writter.