Добрый день!
Подскажите, пожалуйста, каким образом система понимает, к какому типу значений относится тот или иной финансовый документ?

В основной записи финансовой позиции есть управляющий параметр Финансовая операция (ФО).
Всем основным счетам присваиваются финансовые позиции: реальные с ФО = 30, которые расходуют бюджет или технические (служебные) с финансовыми операциями 50, 60, 90.

При проводках данная информация анализируется, и для различных сочетаний фин. операций система определяет тип значения.
Например:
30 / 60 - счет-фактура (54);
60 / 90 или 30 / 90 - платеж (57), если есть код ОГК - авансовый платеж (61).

Более подробная информация есть в хелпе (help.sap.com).