Добавил аналитику "Функциональная сфера", теперь при записи договора выскакивает ошибка "УБ-контировку FOND1/CFO_1.1/STATJA1.1/- нельзя провести в регистр проводок 9A".
Как вылечить?

У Вас в контировку не прописывается Функциональная сфера. Необходимо настроить деривацию Функцональной сферы в транзакции FMDERIVE.

Я внес "Функциональную сферу" в настройку стратегии деривации. К сожалению выскакивает та же ошибка.

Проверяйте тогда заполнено/заполняется ли поле, с которого идет деривация в Функциональную сферу (ФС), при вводе документа.

Откуда хотите чтобы шла деривация в ФС и как Вы ее прописали в FMDERIVE?

СПБ сделали?
FMBSBO_MULT - Структурный план бюджета -> Контировка бюджета -> Массовая обработка
FMBSPO_MULT - Структурный план бюджета -> Контировка проводки -> Массовая обработка

Создал я варианты контировок для СПБ.

судя по сообщению не видит система ФС при вводе проводки, смотрите в трассировке где она у Вас слетает