Подскажите, пожалуйста,
за один и тот же период была дважды внесена одна и та же сумма ручной амортизации через транзакцию ABMA. Каким образом можно отменить одну из запланированных к проводке сумм? Спасибо

Сторнировать одну из проводок

Дело в том, что проводки еще не было. Задача - отменить запланированные суммы.

Сделать за то же месяц, с другим знаком

какой при этом вид движения выбрать? Единственный, который разрешает сделать с обратным знаком - это 330. Но этот вид движения не влияет на амортизацию.

Я так понял вы сделали это 600 ВДВ.
Соответ. создайте свой ВДВ на основе 600, только поставьте контировка не по кредиту, а по дебету

Вы же проводили амортизацию специальным видом движения? Ну и что с того, что проводок не сделано, если есть вид движения - его можно сторнировать (ab08). проводок не было при прямом документе, не будет при сторно... но при расчете амортизации - он не будет учитываться.
Это нормальная ситуация.