бухгалтерам нужно уменьшить первоначальную стоимость основного средства на определённую сумму, причём только по одной, налоговой, области оценки.
можно ли это как-то сделать?

Мне кажется, проще всего создать вид движения для выбытия - только для налоговой области оценки и провести выбытие в ABAVN указывая этот вид движения.

а скажите, можно ли такое частичное выбытие провести задним числом?
дело вот в чём: письмо министерства финансов РФ от 6 мая 2005 г. № 03-03-01-04/1237 "Единый социальный налог, относимый пп.1 п.1 ст.264 Кодекса к прочим расходам, связанным с производством и (или) реализацией, не увеличивает первоначальную стоимость основного средства, возводимого хозяйственным способом, и относится к расходам в зависимости от выбранного метода учёта доходов и расходов".
пересчитать первоначальную стоимость ОС по налоговому учёту хотят аж с начала 2005 года. то есть и амортизация налоговая должна быть пересчитана с начала 2005 года.
наверняка, кто-то уже сталкивался с такой проблемой? как Вы её решали?
заранее благодарю.

Поставьте в проводке в поле "Ссылочная дата " 01.01.2005, тогда вместе с первоначальной стоимостью уберется амортизация от начала года.

что нужно сделать, чтобы вид движения позволял частичное выбытие?
а то у меня ошибку выдает: "Выбытие во Внешний запас невозможно (Внешний запас не существует).

Выбытие разделяется на выбытие поступлений текущего года и прошлых лет. Надо посмотреть настройку кода движения и когда было поступление. Когда делаете частичное выбытие, проверьте,какой индикатор у вас стоит в закладке частичного выбытия:из старого запаса или нового поступления

необходимо создать вид движения для выбытия ОС нового поступленич, так как есть и старого только для одной области оценки и все.