Добрый день.
Можно ли сделать так, чтобы проверка доступности материала в сбытовом заказе учитывала Вид оценки закупаемого материла?

Такой функционал есть в выборе партии в поставке, см. 'выбор запаса'.

Партия и вид оценки - разные вещи.
Партия - это часть запаса, вид оценки - элемент оценки товара.
Проверка доступности для партии - такое есть и в стандарте работает.
Если у вас используются виды оценки для партий, посмотрите в сторону функционала выбора партий, предложенного JH.