Нашёл в SPRO (ОЛ - Отгрузка - Поставки - Определение типов позиций для поставок) настройки для типа позиции. Там есть п. "Провер Свехпоставки". Ставлю там "А" или "B" - всё равно, сверхпоставка проводится без всяких проблем

UPD: пока писал - наткнулся на ноту 1514546 (OSS) "Delivery Tolerance not reflected correct in an outbound delivery":
The overdelivery tolerance functionality is available only for the deliveries created with reference to sales orders and not for deliveries created with reference for PO's or STO's
The functionality for over/under delivery tolerance for STOs (stock transport order) and POs (purchase order) is not available in the standard.
Так как я создаю поставку со ссылкой на стандартный заказ на поставку (PO), то проверка сверхпоставки и не обрабатывается...
Тогда надо абапить в месте, где попозиционная обработка идёт.