Кто-нибудь использует стандартную функциональность "Консигнация"? Как получить проводки по 45 счету при передаче консигнанту? Если не использовать 45 счет, то как формировать баланс?

Количественно оценить товары у консигнанта можно, по стоимости - - в стандарте - нет. Можно наабапить проводку на 45 счет при кажом отпуске материала по заказу KB, но надо про сторно не забыть. Также можно глянуть функциональность запаса под заказ клиента, но и там, по-моему, 45-й счет отдельно не выделить. Нету в САПе нормального 45-го счета, не знают они что это такое

А кто-нибудь еще может подсказать, как по заказу консигнации (КВ) делать исходящую поставку не из свободно используемого запаса, а из особого запаса клиента?

Смысл не понятен.
Товар переданный консигнанту является вашей собственностью. (Зачем 45-й счет?).
У нас по стандарту: КВ -> в запас клиента, КЕ -> 45-й счет ->ППП -> Фактура.
Работает нормально и бухгалтерия довольна.

Интересненько, проведите кратенько ликбез что именно делает система по шагам, плиззз...
Я так понимаю консигнация это продажа по комиссии?

Я думаю, для этого необходимо в настройке типа позиции указать код особого запаса 'E'

Сабж в стандарте реализуется через функциональность реализация выручки в контировках

Ты неправ. В рамках одного объекта оценки (завода или вида оценки к партии) для запаса типа 'E' можно назначить свой класс оценки, а следовательно, другой счёт, например, 45-й.
А чтобы всё делалось действительно красиво, надо не запас типа 'E', а внедрять функциональность TSW. Только этот модуль в России пока ещё никто не купил...

Я так понял, что требуется на 45 счет учитывать товары, переданные на комиссию?
Если так, то самый простой вариант:
Завод "Товары переданные на комиссию" - настроить оценку для этого завода на 45 счет.
Товар принимается на этот завод под заказ клиента, т.о. есть аналитика и по комиссионеру и проводки на 45 счете.
Единственный минус - вручную проводки переноса 45/41 под заказ клиента тяжело делать. Мы автоматизировали этот процесс.