Необходимо загрузить Excel на сервер приложений (как текст), чтобы потом считать во внутреннюю таблицу с помощью READ DATASET.
Пробовал сохранять как текстовый с разделителями (табуляцией) - при просмотре на сервере появляются откуда-то # вместо пробелов.
Подскажите пожалуйста, как сохранить этот файл, чтобы потом без проблем считать во внутреннюю таблицу.

а какая цель у двухэтапной загрузки? разве нельзя загружать файл с клиентской машины сразу во внутреннюю таблицу?
попробуй сохранять из Excel в utf8 и загружать с клиентской машины с указанием кодировки 4110:

CALL METHOD cl_gui_frontend_services=>gui_upload
EXPORTING
filename = fname
filetype = filetype
has_field_separator = ' '
codepage = '4110'
IMPORTING
filelength = data_tab_size
CHANGING
data_tab = data_tab[]
.

OPEN DATASET perffile FOR OUTPUT IN legacy TEXT MODE.
LOOP AT data_tab.
TRANSFER data_tab TO perffile.
ENDLOOP.
CLOSE DATASET perffile.

Знаком диеза заменяются таблуяции только для вывода на экран, в ABAP-переменных всё в порядке. А пробелы, наверное, вообще никто не трогал.
Так что смело можно делать split at cl_abap_char_utilities=>horizontal_tab.

Два этапа нужны для тестирования. Просто есть досовский файл из AS/400. Он нормально грузится в SAP. Но если его отредактировать в Excele, то потом непонятно, как сохранить, чтобы не было проблем с пробелами.

sibrin правильно говорит, нужно кроме всего прочего смотреть в отладчике, при выводе на экран могут быть доп.замены. особенно если используется юникод.
а если дело только в том, чтобы определить кодировку, в которой идет выгрузка из AS/400 - может на этом и надо сконцентрироваться?