Мне кажется, что нужно отражать ситуацию в системе "как есть".
Просто при смене в 12 часов, что работник делал еще 4 часа? Что покажут в табеле? По договору, у работника установлено и должно быть отмечено 12 часов в табеле. У него 8. Как отмечать еще 4? И как будут объясняться с инспекциями, если работник себе за 4 часа где-то сломает ногу?
Если он отсутствовал, то пусть вводят отсутствие без оплаты на 4 часа, если работал, то пусть получает деньги за 4 часа.
В теории, можно сделать правило в расчете ЗП, которое будет заменять кол-во часов (можно, его прописать в T554C, можно перед расчетом среднего).
Но тогда нужно сразу предусмотреть, что:
1) могут быть работники с сокращенным временем
2) могут быть работники с определенным процентом занятости
Использование таблицы RUTIMES здесь наверное не подойдет, т.к. там есть только производственный календарь, а вам для работника, который по своему графику работает в субботу, тоже нужно будет проставить 8 часов, верно?
В общем, не тащите лишний бардак в систему
P.S. Замещение, на мой взгляд, делать не совсем корректно, т.к. уменьшается кол-во плановых часов, которое используется для средних.