Нужно выводить на экран иерархическую структуру организационных единиц предприятия с перечнем сотрудников, которые числятся в каждой из них. Пользователь будет отмечать один или несколько табельных номеров.

Какие специализированные функциональные модули можно использовать в программе для вывода иерархической структуры модуля HR (вывода соответствующих деревьев и их обработку).
??

Персонал -> Орг. менеджмент -> Информационная система -> Организационная единица -> Организационная структура

Там четыре транзакции для просмотра структуры с любыми настройками....

Насколько я понял нужна S_AHR_61016494....

ФМ 'RH_OBJID_REQUEST'
для мультивыбора - параметр set_mode = 'X'

А какие параметры чтобы вывод структуры внутри определённой организационной единицы сделать?

Нет таких параметров.
Но можно ограничить вывод структурными полномочиями.