Необходимо генерировать лимиты отсутствия без использования оценки времени. Планируем запускать программу для начисления/пересчёта лимитов ежедневно.

Документация:
HRUTQTA0 - Создание лимитов отсутствий (Россия). Отчет служит для создания и обновления записей в инфо-типе Лимиты отсутствий (2006).
RPTQTA00 - Создание лимита отсутствий. Используется для автоматического начисления права сотрудников на отсутствие инфо-тип (2006).
Соответственно, склоняемся к российской локализации.

Что более правильно использовать HRUTQTA0 или RPTQTA00?

Дык суть в названиях. Один для создания и обновления, а другой для генерации приращений от периода к периоду. Я так себе это понимаю

HRUTQTA0 учитывает российскую специфику. В частности, может смещать дату окончания отпускного периода на время некоторых отсутствий (отпуск по уходу за ребенком) Так же может относить перерасход лимита при увольнении на технический лимит 90-перерасход отпуска.
И может генерить лимиты отсутствий (60 или 45 дней) для больничных по уходу за ребенком в зависимости от спец поля в ИТ 21.

а начисление приращений лимита HRUTQTA0 может выполнить? например, за вредные условия труда. Или для этого надо использовать RPTQTA00?

С настройкой приращений я не сталкивалась. Может кто другой ответит.
Но это же зависит от настроек для типа лимита. Можно просто запустить генерацию в тестовом режиме и проверить.

Подскажите, пожалуйста, как настроить смещение отпускного периода на время отсутствия (отпуск по уходу за ребенком)?
Или может есть какой-либо источник, где можно почитать про настройку.
Спасибо.

Есть стандартное саповское решение, ищите в нотах (не подскажу сходу), плюс в смежной ветке это уже обсуждают.

to vitta

Таблица V_T7RU_T559D, переключатель Смещ.кон.,
в спро - в меню лимиты-Специфические для России настройки-Определить период действия по умолчанию.
В табл V_554S_M отмечаем отсутствия, которые удлиняют период действия лимита.

САП к этой теме выпустил новую ноту 2231261 с исправлением расчета дней при увольнении в период, когда была смещена дата и период стал больше года