В связи с техническим сбоем при создании ММ-фактуры в MIGO не создался FI-документ. При попытке сторнировать MM-фактуру пишет:
“Сторно невозможно, для ссылки нет бухгалтерского документа.
№ сообщения F5A009”.
Как победить неконсистентность данных? Вручную удалять из ММ-таблиц (RBKP, RSEG)?

В продуктивной системе? Не надо.

Поищите ноты на эту тему, напишите в поддержку SAP.

Ноты есть - 1437923, 951583, они помогут избежать ошибок в будущем, но как исправить имеющуюся ошибку...

Если система продуктивная, то надо выставлять сообщение в SAP, они должны это исправить.
Способ исправления у них обычно такой - запускают сторнирование документа и в отладчике для сторнирующего документа пропускают создание FI-документа.

Спасибо, будем пробовать.

К сожалению, выставлять сообщение в SAP мы не можем - нет поддержки. С FI-понятно. Нашли ФМ, где можно пропустить создание FI-документа. Тут есть еще проблема с регистром материала - документ по регистру материала так же не создался (в CKMC виден разрыв по данному материалу между ММ и регистром материала). Подскажите, как при сторно можно пропустить создание документа регистра материала? Возможно ли такое, и какие проблемы могут быть при закрытии периода после таких манипуляций?

рассмотрите вариант (поговорите с бухгалтерами-fi щиками)забить на цепочку документов, списать разницу на какой то другой счет, сделать какую то обратную проводку.

Тут только путем экспериментов и общения со специалистами блока СО...
Попробуйте скопировать мандант и для начала сделать сторно с отцеплением только для бухгалтерской проводки, возможно этого будет достаточно (точно не помню, но мне казалось что CO документ как раз формируется из FI документа, а не напрямую из MRM).

Именно так сделали, помогло. Спасибо.