Подскажите, есть ли такая настройка и если есть то где: указать, что завод работает без НДС.
Через Mek1 пыталась настроить условие, но не совсем подходит.

А что значит "завод работает без НДС"?
Закупает все материалы без НДС, независимо от ставки налогообложения на эти материалы? а это как так?
Поясните ситуацию, плиз.

Бе к которой принадлежит завод работает по ЕНВД, и то что приходит на этот завод мы приходуем не выделяя НДС, НДС включается в стоимость. Калькуляцию мы настроили, НДС не выделяется, но при перемещении между БЕ в строчке с суммой проставляется код НДС. Я так думаю, что он тянется из заказа на перемещение. Как обойти это?

Изменить схему калькуляции в заказе на перемещение (выкинуть оттуда НДС). По-моему, очевидно. Или присвоить для таких случаев код НДС с НДС=0%.

При перемещении НДС должно выделиться в БЕ1, поэтому НДС выкинуть из калькуляции нельзя. А вот в БЕ2 придти должно без выделения НДС, но НДС должно быть включено в стоимость.
В калькуляции настроено, что НДС в БЕ2 выделяться не должно, но код НДС не пропадает и проставляется в строке с общей суммой.