MI31 создает несколько документов инвентаризации по 300 строк.

J3RALFINV3 при выборе по всем этим документам печатает столько форм ИНВ-3, сколько документов выбрано. Но бухгалтер утверждает, что форма должна быть одна для склада.

Есть ли возможность в стандарте печатать одну форму ИНВ-3 для нескольких документов инвентаризации?

Стандартом никак. Договорились с бухгалтерией связывать такие документы через ссылочный номер инвентаризации и выдавать несколько документов с форматом номера: ссылочный номер инв-и/номер инв-и