Добрый день,
есть ли какая-нибудь настройка, которая зависит от пользователя,
у одного пользователя на экране есть это поле MARA-LABOR у другого нет, в чем может быть причина?

виды материала разные?
варианты транзакций?
группы вариантов?

Конечно, от пользователя может зависет последовательность экранов, а следовательно и набор полей.
Общая логистика-Основные записи-Конфигурация ОЗМ-Присвоение последовательности экранов пользователям.

Ни пользователя у которого светится это поле ни у кого не светится нет в этой настройке.
Может это какой-то глюк?

1. Ответьте на вопросы SAA чтоб можно было лучше понять.
2. Там не пользователи указываются, а ссылочный номер для последовательности. Учтите это.
3. Возможно какая-то разработка.