Добрый день!
Ситуация следующая: был заведен заказ в валюте, две позиции, по каждой порядка 60 поступлений.
В результате возникла разница в 7 центов (видимо, из-за различных округлений). При попытке регистрации счет-фактуры в MIRO система подхватывает стоимость не из заказа (объем заказа * цена), а из суммы поступления. Получается, что в MIRO счет-фактура не соответствует фактическим данным.
Как быть?

Ввести в позициях СчФ и в заголовке те суммы, которые указаны на бумажной СчФ.

да, но в позициях СФ все стоимости верно стоят по правилам округления, получается, надо в случайные позиции добавить по центу?

Вы хотите сказать, что позиции сходятся с бумажной CчФ, а сумма не сходится?
Тогда может ошибка в бумажной СчФ?

я не смотрел бумажную СчФ. смотрел в сумму в заказе на уровне заголовка (закладка статус).
Там такая информация:
Заказано 459.889 кг 586.183,71 USD
Поставлено 459.889 кг 586.183,64 USD

вот это расхождение и смутило.
получается, можно оприходовать весь объем заказа, а при регистрации СчФ нельзя просто принять на веру ту сумму, которая подхватится из заказа (а подхватится 586.183,64 USD). Надо всегда проверять.

На веру точно нельзя, потому что вы должны заводить первичные документы в систему ровно в том виде, в каком они пришли. Поэтому все суммы должны совпадать с бумажной фактурой. То, что система расчитывает суммы на основе заказа всего лишь помощь при регистрации счета-фактуры.