Подскажите плиз в каких таблицах хронятся складские остатки?

Открывайте top-инклюд к программе RMMMBESTN (танзакция MMBE).
Там все перечислено в разделе TABLES.

Складские в MCHB.

MARD – Запасы по складам
MCHB – Запасы по партиям (и складам)
MSPR – Запасы по проектам
MLIB – Запасы ДавальчМтрл у поставщика
MSKA – Запас для заказа клиента

При этом не забываем, что если материал ведется по партиям, то он будет и в MARD, и в MCHB. А если, например, в партиях да еще и под заказом клиента - то будут записи в MARD, MCHB и MSKA. Поэтому если часть материалов не ведется в партиях, а часть ведется - общий алгоритм расчета запаса будет не очень прост. Если тупо выводить строки из трех таблиц - получим больше, чем есть на самом деле

А я всегда думал что особые запасы не пересекаются с обычными запасами, т.е. в трёх таблицах MCHB, MSKA и MSPR хранятся разные данные и они не пересекаются.

Еще MKOL -Консигнационный запас