Коллеги, добрый день. Хотел бы спросить, от чего можно оттолкнуться. Требуется создать программу, которая бы в фоновом режиме отслеживала определенные зависшие очереди по определенным критериям, после делала автоматом перемещение запаса с одного ММ склада в ERP на другой.

Вы бы уточнили, про какие именно очереди говорите.
Есть очередь QRFC в SMQ2, есть TRFC в SM58, есть сериализованные IDOC в BD87..

QRFC в SMQ2, допустим очередь на ОМ по поставке

Ну, посмотрите код стандартной программы RSQIWKEX.
Я так понимаю, ФМ TRFC_QIN_GET_ERROR_QUEUES даст список проблемных очередей, ФМ TRFC_QIN_RESET_LUW позволяет запустить заново обработку проблемного LUW.