Есть закупочная цепочка: заказ - ВхПоставка - транспортировка - фрахт - ПМ - MIRO (на фрахт и на закупку).
Делают возврат части товара по исходному заказу через 122 вдв. При этом в проводку возвратную попадает часть фрахта, которой там быть не должно.

Есть, может, какие-то настройки, которые этим управляют? И как это можно включить в процесс? Если был подобный опыт...

Попробуйте возвращать с помощью логистической схемы (ВДв 161, через исходящую поставку), формируя возвратную позицию заказа на поставку без ссылки на исходный заказ (при этом ссылку на исходный заказ прописывайте где-то в левом поле или, например, в текстах заголовка заказа на поставку). В этом случае, очевидно, связи с исходным заказом не будет, и "возвращать" ТЗР система не попытается.

ТЗР возвращается, потому что он дооценивает запас, и если запас уменьшается, то и оценку его надо уменьшить. Тут два варианта:
- отцепить возврат от входящей поставки и возвращать номинально из свободного запаса, как предлагает Михаил (простой вариант);
- отцепить ТЗР от поставки и делать ТЗР отдельным заказом. а потом дооценивать запас (сложный вариант).

Да, в итоге делали через 161, просто интересно, можно ли это сделать через 122 без участия фрахта. Видимо, нельзя.